국가연구개발사업을 통해 발표된 논문 수는 늘어났지만 질적 수준은 오히려 떨어진 것으로 나타났다. 

SCI논문은 2006년1만2천881건에서 2007년 1만4천589건으로 늘었다. 하지만 SCI Impact Factor(IF)는 2006년 2.53에서 2007년 2.44로 줄었다. 또 국가연구개발사업 과제에서 나온 정부 R&D 전체 SCI논문 표준화 순위보정지수도 2006년 64.2에서 2007년 63.9로 떨어졌다.

표준화 순위보정지수는 학문분야별로 편차를 보이는 IF활용의 한계점을 개선하기 위해 분야별로 SCI IF를 보정한 지표다. 100에 가까울수록 동일 분야 내에서 SCI Impact Factor Ranking에 높다.

교육과학기술부(이하 교과부)와 한국과학기술평가원은 2006년과 2007년 국가연구개발 사업 결과로 나온 논문과 국내 특허 등 성과에 대한 분석 결과를 발표했다. 연간 약 10조원이 투입되고 있는 국가연구개발 전체를 대상으로 종합적 분석이 나온 것은 이번이 처음이다.

 성과분석 결과에 따르면 SCI논문은 2006년 1만2천881건에서 2007년 1만4천589건으로 13.3% 늘어난 것으로 나타났다.

이 가운데 대학에서 수행한 기초연구 과제에서 전체 SCI 논문의 43.8%이 산출됐다. 분야는 물리학, 화학 기초과학 분야에서 피인용도 높은 논문이 많이 나왔다. 학문분야별 표준화 순위보정지수 기준으로 물리학은 74.9, 화학은 73.2를 기록했다. 정부 R&D 평균은 63.9다.

SCI 논문을 가장 많이 발표한 대학은 서울대(1천444건)였다. 연세대(684건), 포스텍(668건), 고려대(579건), 카이스트(560건)가 뒤를 이었다. 표준화 순위보정지수가 가장 높은 대학은 포스텍(72.9)로 나타났고, 이어 카이스트(70.5), 연세대(70.3), 광주과학기술원(69.0), 이화여대(68.7)로 집계됐다.

또 대학 단독연구보다 국제 공동연구에서 양질의 논문이 나왔다. 국제공동연구에서 발표된 논문의 표준화 순위보정지수(70.2)가 대학 단독연구 지수(66.0)보다 높았다.

<대학과 정부출연연구기관 중 논문 발표 상위 연구기관, 2007>

(단위: 건, 억원, 건/억원)

순위	대학			정부출연연구기관
	기관명	논문수 (’07년)	투자액 (’05~‘07년)	기관명	논문수 (’07년)	투자액 (’05~’07년)
1	서울대학교	1,444	6,455	과학기술연구원	413	4,076
2	연세대학교	684	2,448	원자력연구원	333	6,133
3	포항공과대학교	668	2,072	생명공학연구원	283	2,644
4	고려대학교	579	1,805	전자통신연구원	224	13,156
5	한국과학기술원	560	2,518	표준과학연구원	181	2,259
6	성균관대학교	470	1,281	화학연구원	144	1,894
7	한양대학교	436	1,710	기계연구원	133	3,304
8	부산대학교	404	1,304	기초과학지원연구원	122	1,424
9	인하대학교	281	1,198	전기연구원	113	1,817
10	경북대학교	266	1,353	해양연구원	101	3,269

<대학과 정부출연연구기관 중 표준화 순위보정지수 상위 연구기관, 2007>

순위	대학				정부출연연구기관
	기관명	논문수 (건)	Impact Factor	표준화 순위보정 지수	기관명	논문수 (건)	Impact Factor	표준화 순위보정 지수
1	포항공과대학교	651	3.03	72.9	천문연구원	72	5.04	79.8
2	한국과학기술원	552	2.80	70.5	표준과학연구원	179	2.02	69.8
3	연세대학교	666	3.23	70.3	과학기술연구원	408	2.43	68.7
4	광주과학기술원	209	2.57	69.0	화학연구원	142	2.59	68.4
5	이화여자대학교	200	3.29	68.7	핵융합연구소	40	1.75	67.0
6	한양대학교	427	2.46	68.7	기초과학지원연구원	121	2.67	66.6
7	서울대학교	1,414	2.88	68.3	기계연구원	131	1.92	66.3
8	성균관대학교	462	2.68	67.1	전자통신연구원	219	1.49	63.8
9	울산대학교	102	3.23	65.7	에너지기술연구원	72	1.71	63.7
10	고려대학교	563	2.41	64.5	지질자원연구원	95	1.39	60.8

                                                                                                         출처:교육과학기술부 2009

                                                                                                          (BK21실적은 제외)